傳統農藥沒有過多考慮對環境汙染這個話題。現在隨著經濟的發展，如今用混合機等一係列設備加工後的化肥農藥，也要以生產綠色農藥為目標。
生物農藥活性成分是自然存在的物質，可分為微生物源農藥、植物源農藥和動物源農藥等三類.
生物農藥是一個完全相對於傳統化學合成農藥的概念，也就是從某些生物中提取原料，製造出的能夠廣譜殺菌、殺蟲的新型農藥。生態農藥活性成分是自然存在的物質，自然界有其順暢的降解途徑，不會汙染環境，因此受到廣泛關注。
微生物源農藥：微生物源農藥是利用微生物(如細菌、病毒、真菌和線蟲等)或其代謝物作為防治農業有害物質的生物製劑。微生物源農藥可分為原生動物型、線蟲型、真菌型、細菌型、病毒型以及農用抗生素。蘇雲金菌屬於芽杆菌類，是目前世界上用途最廣、開發時間最長、產量最大、應用最成功的生物殺蟲劑。昆蟲病原真菌屬於真菌類農藥，對防治鬆毛蟲和水稻黑尾葉有特效，根據真菌農藥沙蠶素的化學結構衍生合成的殺蟲劑巴丹或殺螟丹等品種，已大量應用於實際生產中。農用抗生素是一類應用廣泛、品種眾多的微生物農藥，它是由微生物產生的次級代謝產物，在低微濃度時即可抑製或殺滅作物的病、蟲、草害或調節植物生長發育的一種製劑。
植物源農藥：在眾多的綠色農藥中，植物源農藥以其在自然環境中自身易降解、無公害的優勢已成為綠色農藥的首選之一，主要包括植物源殺蟲劑、植物源殺菌劑、植物源除草劑及植物光活化黴素等。到目前為止，自然界已發現的具有農藥活性的植物殺蟲劑有除蟲菊素、煙堿和魚藤酮等。除蟲菊素和煙堿已經成功地作為先導化合物，開發出了一係列新型高效殺蟲劑，曆史性地改變了傳統農藥的麵貌。1972年，從印楝樹的種子中提取的印楝素作為害蟲的拒食劑和生長抑製劑，對多種害蟲有效。現在有許多印楝素製劑實現了商品化。
動物源農藥：動物源農藥主要分為兩類：一種是直接利用人工繁殖培養的活動物體,如寄生蜂、草蛉、食蟲食菌瓢蟲及某些專食害草的昆蟲，以殺死農作物上的病蟲害；一種是利用動物體的代謝物或其體內所含有的具有特殊功能的生物活性物質，如昆蟲所產生的各種內、外激素，這些昆蟲激素可以調節昆蟲的各種生理過程，以此來殺死害蟲，或使其喪失生殖能力等。